Xəzər Universiteti İnnovasiya Mərkəzinin əsas məqsədi biznes dünyası ilə universitetin arasında qarşılıqlı əlaqələr sistemini təşkil etməkdir. Mərkəz universitetlə birgə tədqiqat aparması üçün texnologiyaya əsaslanan bizneslərə müəllim və tələbələrin imkanlardan öz xeyirinə istifadə etmək və universitetin kitabxana laboratoriyalar, avadanlıq, xidmətlər və s. kimi resurslarına sərbəst daxil olaraq, onlardan yararlanmaq üçün şərait yaradılmışdır. Xəzər Universiteti İnnovasiya Mərkəzi sinif otaqlarında və laboratoriyalarda əmələ gəlmiş ideyaları real şərtlər mühitində yoxlayaraq, akademik missiyanı zənginləşdirir. Bundan başqa, mərkəz tələbələrə sənaye ilə birbaşa təcrübə və araşdırma imkanları təklif edir. Mərkəz ən yaxşı müəllim və tələbələrini cəlb etməyə və saxlamağa kömək edərək, Universitetin akademik missiyasını dəstəkləyir.